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山東醫藥技師學院實行院、系兩級管理體制，設有基礎部、中藥學院、藥品商貿學院、制藥工程學院、生物工程系（升學部）、食品科學系、健康管理系。專業設置齊全，開設中藥、藥品營銷、中藥制藥、藥物制劑、化學制藥、藥物分析與檢驗、生物制藥、保健按摩、健康服務與管理、老年服務與管理、食品加工與檢驗、食品質量安全等近三十個專業。
2023年招生專業計劃表
| 2023年招生計劃 | ||||
| 院系 | 專業名稱 | 秋季計劃數 | 春季計劃數 | |
| 中藥學院 | 高中起點 | 中藥（神農班技師4年） | 50 |
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| 中藥（預備技師4年） | 50 | 50 | ||
| 中藥制藥（預備技師4年） | 50 |
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| 中藥（預備技師3年） | 50 |
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| 初中起點 | 中藥（預備技師3+3年） | 200 | 50 | |
| 中藥制藥（預備技師3+3年） | 150 |
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| 中草藥種植（中級工3年） | 50 |
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| 校企合作班中藥專業（中級工3年） | 100 |
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| 中藥學院合計 | 700 | 100 | ||
| 藥品商貿學院 | 高中起點 | 藥品營銷（預備技師4年制） | 50 |
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| 初中起點 | 藥品營銷（預備技師3+3年制） | 250 |
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| 醫藥物流（預備技師3+3年制） | 50 |
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| 電子商務（預備技師3+3年制） | 50 |
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| 連鎖經營與管理（預備技師3+3年制） | 50 |
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| 校企合作班藥品營銷專業（中級工3年） | 50 | 50 | ||
| 藥品商貿學院合計 | 500 | 50 | ||
| 制藥工程學院 | 高中起點 | 藥物制劑（預備技師4年） | 50 |
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| 校企合作藥物制劑（預備技師4年） | 50 |
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| 初中起點 | 藥物制劑（預備技師3+3年制） | 200 | 50 | |
| 藥物分析與檢驗（預備技師3+3年制） | 50 |
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| 化學制藥（預備技師3+3年制） | 50 |
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| 校企合作藥物制劑（高級工5年） | 100 |
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| 制藥工程學院合計 | 500 | 50 | ||
| 生物工程系（升學部） | 初中起點 | 春考護理方向 | 200 |
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| 春考醫學技術方向 | 200 |
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| 春考藥學方向 | 300 |
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| 生物工程系（升學部）合計 | 700 |
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| 食品科學系 | 初中起點 | 生物制藥（預備技師3+3年） | 150 |
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| 食品加工與檢驗（預備技師3+3年制） | 50 |
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| 公共營養保健（預備技師3+3年制） | 50 |
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||
| 食品科學系合計 | 250 |
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| 健康管理系 | 初中起點 | 健康與社會照護（預備技師3+3年制） | 100 |
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| 保健按摩（預備技師3+3年制） | 100 |
|
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| 康復保健（預備技師3+3年制） |
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| 老年服務與管理（預備技師3+3年制） | 100 |
|
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| 健康服務與管理（預備技師3+3年制） |
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| 初中起點 | 幼兒教育（預備技師3+3年制） | 50 |
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|
| 健康管理系合計 | 350 |
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| 全院合計 | 3000 | 200 | ||
◆專業除大專合作班外免除所有學費；
◆涉農專業（中草藥種植）學生在校期間享受每生每年2000元國家
助學金；
◆非涉農專業家庭困難學生10%的同學可通過個人申請享受2000元
國家助學金；
◆中級工學生在校期間符合報讀預備技師條件后，可以升入預備技師班學習；
◆在校期間可輔修“國家開放大學”大專課程，完成規定學分取得國
家承認的大專畢業證；可參加“山東大學”、“山東中醫藥大學”
等成人大專課程學習，成績合格頒發國家承認學歷的大專畢業證
書。大專教育階段學費自理;
◆初中起點報名學生年齡不小于14周歲（2017年6月30日之前出生）；
◆高中起點報名學生年齡不小于16周歲（2005年6月30日之前出生）;
◆廣聯醫藥報名對象為女生，魯南制藥報名對象為男生報名。
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